Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms