Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA7P36544 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms