Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP5A1P25705 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP5A1P25705 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP5A1P25705 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP5A1P25705 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP5A1P25705 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP5A1P25705 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP5A1P25705 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP5A1P25705 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5A1P25705 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms