Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC175P0C221 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms