Protein–RNA interactions for Protein: P04233

CD74, HLA class II histocompatibility antigen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD74P04233 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD74P04233 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD74P04233 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD74P04233 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD74P04233 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD74P04233 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD74P04233 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD74P04233 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD74P04233 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD74P04233 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD74P04233 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD74P04233 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD74P04233 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD74P04233 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD74P04233 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD74P04233 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD74P04233 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD74P04233 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD74P04233 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD74P04233 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD74P04233 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD74P04233 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD74P04233 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD74P04233 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD74P04233 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD74P04233 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD74P04233 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD74P04233 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD74P04233 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD74P04233 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD74P04233 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD74P04233 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD74P04233 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD74P04233 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD74P04233 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD74P04233 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD74P04233 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD74P04233 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD74P04233 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD74P04233 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD74P04233 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD74P04233 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD74P04233 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD74P04233 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD74P04233 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD74P04233 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD74P04233 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD74P04233 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD74P04233 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD74P04233 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CD74P04233 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD74P04233 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD74P04233 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD74P04233 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD74P04233 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD74P04233 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD74P04233 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CD74P04233 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD74P04233 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD74P04233 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD74P04233 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD74P04233 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD74P04233 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD74P04233 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD74P04233 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD74P04233 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD74P04233 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD74P04233 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD74P04233 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD74P04233 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CD74P04233 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD74P04233 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD74P04233 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD74P04233 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD74P04233 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD74P04233 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD74P04233 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD74P04233 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD74P04233 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD74P04233 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD74P04233 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD74P04233 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD74P04233 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD74P04233 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD74P04233 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD74P04233 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD74P04233 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD74P04233 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD74P04233 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD74P04233 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD74P04233 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CD74P04233 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD74P04233 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD74P04233 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD74P04233 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD74P04233 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD74P04233 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD74P04233 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD74P04233 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD74P04233 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms