Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J7

TIMM9, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim9, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM9Q9Y5J7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms