Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM8Q9BZR9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM8Q9BZR9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms