Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms