Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 AC068985.1-201ENST00000463297 703 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 AC055748.1-201ENST00000489836 959 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 HMGB1P8-201ENST00000558211 949 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 CSNK1A1-209ENST00000606299 1075 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms