Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.856e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.83e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 UBE2J2-219ENST00000503294 814 ntTSL 420.02■□□□□ 0.83e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 UBE2J2-206ENST00000422076 643 ntTSL 520.02■□□□□ 0.83e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.792e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.756e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.756e-7■■■■■ 47.1
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TBRG4Q969Z0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.662e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 WWTR1-209ENST00000479238 697 ntTSL 319.12■□□□□ 0.656e-7■■■■■ 47.1
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TBRG4Q969Z0 CD63-213ENST00000552164 845 ntTSL 218.73■□□□□ 0.592e-8■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 PAXBP1-204ENST00000443785 2920 ntTSL 1 (best)18.67■□□□□ 0.583e-10■■■■■ 47.1
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TBRG4Q969Z0 VPS72-201ENST00000354473 1347 ntTSL 318.46■□□□□ 0.553e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.513e-10■■■■■ 47.1
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TBRG4Q969Z0 TBCD-207ENST00000571796 1940 ntTSL 1 (best)17.96■□□□□ 0.473e-10■■■■■ 47.1
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TBRG4Q969Z0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.456e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 ZFAND2A-202ENST00000397083 852 ntTSL 1 (best)17.84■□□□□ 0.456e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.456e-7■■■■■ 47.1
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TBRG4Q969Z0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.376e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.376e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.366e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.343e-10■■■■■ 47.1
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TBRG4Q969Z0 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.223e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.226e-7■■■■■ 47.1
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TBRG4Q969Z0 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.023e-10■■■■■ 47.1
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TBRG4Q969Z0 UNKL-213ENST00000513783 582 ntTSL 414□□□□□ -0.172e-7■■■■■ 47.1
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TBRG4Q969Z0 CD63-203ENST00000546457 607 ntTSL 213.69□□□□□ -0.222e-8■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.227e-8■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 EFCAB11-212ENST00000556639 2326 ntTSL 513.69□□□□□ -0.221e-6■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 ZFYVE21-209ENST00000555501 4453 ntTSL 1 (best)13.64□□□□□ -0.233e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.233e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.242e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 ZNF627-203ENST00000587939 591 ntTSL 413.52□□□□□ -0.256e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 PIK3CD-202ENST00000377346 5203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.253e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.273e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 PPARG-206ENST00000397012 2006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.286e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 ARMC9-215ENST00000614261 4975 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.293e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 DNMT3A-204ENST00000380756 4477 ntTSL 1 (best)13.23□□□□□ -0.296e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 AACS-201ENST00000316519 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.343e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 DNMT3A-202ENST00000321117 4279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.346e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 PPARG-212ENST00000455517 428 ntTSL 1 (best)12.87□□□□□ -0.356e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 PPARG-210ENST00000397029 686 ntTSL 312.73□□□□□ -0.376e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 SMYD3-207ENST00000462422 971 ntTSL 512.69□□□□□ -0.383e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 UNKL-210ENST00000508903 3430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.416e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 LRSAM1-202ENST00000323301 3376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.437e-8■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 OXA1L-209ENST00000495424 1679 ntTSL 212.22□□□□□ -0.453e-10■■■■■ 47.1
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