Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVR3

C7orf43, Uncharacterized protein C7orf43, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf43Q8WVR3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C7orf43Q8WVR3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms