Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NLRP13Q86W25 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NLRP13Q86W25 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NLRP13Q86W25 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NLRP13Q86W25 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NLRP13Q86W25 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NLRP13Q86W25 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms