Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms