Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms