Protein–RNA interactions for Protein: Q14722

KCNAB1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB1Q14722 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNAB1Q14722 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms