Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms