Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BECN1Q14457 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BECN1Q14457 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
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