Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
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