Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF11Q05519 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms