Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHC1P78364 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHC1P78364 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHC1P78364 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHC1P78364 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHC1P78364 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHC1P78364 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHC1P78364 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHC1P78364 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHC1P78364 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHC1P78364 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHC1P78364 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PHC1P78364 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHC1P78364 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHC1P78364 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PHC1P78364 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHC1P78364 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHC1P78364 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHC1P78364 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHC1P78364 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHC1P78364 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHC1P78364 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHC1P78364 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHC1P78364 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHC1P78364 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHC1P78364 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHC1P78364 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PHC1P78364 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHC1P78364 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHC1P78364 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHC1P78364 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHC1P78364 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHC1P78364 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHC1P78364 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHC1P78364 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHC1P78364 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHC1P78364 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHC1P78364 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHC1P78364 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHC1P78364 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHC1P78364 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHC1P78364 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHC1P78364 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHC1P78364 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHC1P78364 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHC1P78364 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHC1P78364 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHC1P78364 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHC1P78364 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHC1P78364 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHC1P78364 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHC1P78364 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHC1P78364 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHC1P78364 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHC1P78364 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHC1P78364 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHC1P78364 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHC1P78364 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHC1P78364 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHC1P78364 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHC1P78364 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHC1P78364 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHC1P78364 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHC1P78364 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHC1P78364 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHC1P78364 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHC1P78364 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHC1P78364 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHC1P78364 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHC1P78364 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHC1P78364 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHC1P78364 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PHC1P78364 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHC1P78364 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHC1P78364 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHC1P78364 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHC1P78364 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHC1P78364 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHC1P78364 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PHC1P78364 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHC1P78364 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHC1P78364 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHC1P78364 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHC1P78364 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHC1P78364 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHC1P78364 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHC1P78364 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHC1P78364 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHC1P78364 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHC1P78364 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHC1P78364 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHC1P78364 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHC1P78364 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHC1P78364 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHC1P78364 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHC1P78364 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHC1P78364 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHC1P78364 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHC1P78364 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHC1P78364 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms