Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS28P62857 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS28P62857 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS28P62857 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS28P62857 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS28P62857 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS28P62857 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS28P62857 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS28P62857 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS28P62857 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS28P62857 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS28P62857 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS28P62857 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS28P62857 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS28P62857 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS28P62857 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
RPS28P62857 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
RPS28P62857 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
RPS28P62857 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
RPS28P62857 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
RPS28P62857 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
RPS28P62857 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
RPS28P62857 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
RPS28P62857 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
RPS28P62857 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
RPS28P62857 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
RPS28P62857 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
RPS28P62857 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS28P62857 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS28P62857 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS28P62857 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS28P62857 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS28P62857 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS28P62857 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS28P62857 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS28P62857 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS28P62857 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS28P62857 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS28P62857 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS28P62857 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS28P62857 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS28P62857 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS28P62857 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS28P62857 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS28P62857 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS28P62857 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS28P62857 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS28P62857 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS28P62857 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS28P62857 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS28P62857 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.2 ms