Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL23P62829 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL23P62829 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL23P62829 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL23P62829 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL23P62829 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL23P62829 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL23P62829 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL23P62829 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL23P62829 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL23P62829 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL23P62829 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL23P62829 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL23P62829 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL23P62829 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL23P62829 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL23P62829 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL23P62829 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL23P62829 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL23P62829 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL23P62829 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL23P62829 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL23P62829 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL23P62829 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL23P62829 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL23P62829 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL23P62829 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL23P62829 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL23P62829 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL23P62829 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL23P62829 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL23P62829 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL23P62829 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL23P62829 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL23P62829 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL23P62829 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL23P62829 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL23P62829 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL23P62829 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL23P62829 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL23P62829 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL23P62829 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL23P62829 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL23P62829 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL23P62829 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL23P62829 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL23P62829 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL23P62829 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL23P62829 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL23P62829 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL23P62829 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL23P62829 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL23P62829 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL23P62829 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL23P62829 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL23P62829 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL23P62829 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL23P62829 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL23P62829 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL23P62829 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL23P62829 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL23P62829 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL23P62829 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL23P62829 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL23P62829 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL23P62829 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL23P62829 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL23P62829 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL23P62829 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPL23P62829 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
RPL23P62829 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPL23P62829 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPL23P62829 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPL23P62829 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPL23P62829 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPL23P62829 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPL23P62829 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPL23P62829 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPL23P62829 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPL23P62829 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPL23P62829 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL23P62829 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL23P62829 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL23P62829 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL23P62829 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL23P62829 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL23P62829 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL23P62829 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL23P62829 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL23P62829 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL23P62829 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL23P62829 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL23P62829 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL23P62829 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL23P62829 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL23P62829 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL23P62829 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL23P62829 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL23P62829 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL23P62829 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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