Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms