Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP107P57740 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP107P57740 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP107P57740 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP107P57740 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP107P57740 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP107P57740 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP107P57740 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP107P57740 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP107P57740 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP107P57740 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP107P57740 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP107P57740 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP107P57740 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP107P57740 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP107P57740 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP107P57740 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP107P57740 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP107P57740 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP107P57740 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP107P57740 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP107P57740 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP107P57740 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP107P57740 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP107P57740 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP107P57740 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP107P57740 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP107P57740 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP107P57740 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP107P57740 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP107P57740 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP107P57740 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP107P57740 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP107P57740 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP107P57740 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP107P57740 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP107P57740 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP107P57740 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP107P57740 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP107P57740 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP107P57740 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP107P57740 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP107P57740 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP107P57740 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP107P57740 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP107P57740 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP107P57740 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP107P57740 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP107P57740 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP107P57740 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP107P57740 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP107P57740 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP107P57740 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP107P57740 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP107P57740 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP107P57740 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP107P57740 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP107P57740 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP107P57740 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP107P57740 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP107P57740 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP107P57740 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP107P57740 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP107P57740 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP107P57740 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP107P57740 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP107P57740 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP107P57740 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP107P57740 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP107P57740 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP107P57740 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP107P57740 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP107P57740 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP107P57740 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP107P57740 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP107P57740 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP107P57740 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP107P57740 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP107P57740 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP107P57740 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP107P57740 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP107P57740 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP107P57740 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP107P57740 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP107P57740 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP107P57740 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP107P57740 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP107P57740 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP107P57740 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP107P57740 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP107P57740 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP107P57740 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP107P57740 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP107P57740 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP107P57740 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP107P57740 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP107P57740 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP107P57740 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP107P57740 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP107P57740 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms