Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms