Protein–RNA interactions for Protein: P09603

CSF1, Macrophage colony-stimulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1P09603 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1P09603 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1P09603 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1P09603 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1P09603 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1P09603 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1P09603 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1P09603 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1P09603 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1P09603 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1P09603 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1P09603 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1P09603 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1P09603 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1P09603 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1P09603 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1P09603 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1P09603 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1P09603 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1P09603 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1P09603 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1P09603 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1P09603 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1P09603 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1P09603 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1P09603 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1P09603 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1P09603 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1P09603 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1P09603 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1P09603 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1P09603 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1P09603 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1P09603 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1P09603 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1P09603 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1P09603 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1P09603 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1P09603 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF1P09603 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF1P09603 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF1P09603 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF1P09603 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF1P09603 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF1P09603 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF1P09603 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF1P09603 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF1P09603 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF1P09603 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF1P09603 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF1P09603 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF1P09603 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF1P09603 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF1P09603 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF1P09603 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF1P09603 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF1P09603 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF1P09603 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF1P09603 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF1P09603 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF1P09603 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF1P09603 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF1P09603 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF1P09603 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF1P09603 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF1P09603 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF1P09603 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF1P09603 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF1P09603 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF1P09603 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF1P09603 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF1P09603 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF1P09603 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF1P09603 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF1P09603 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF1P09603 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF1P09603 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF1P09603 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF1P09603 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF1P09603 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF1P09603 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF1P09603 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF1P09603 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF1P09603 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF1P09603 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF1P09603 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF1P09603 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF1P09603 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF1P09603 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF1P09603 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF1P09603 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF1P09603 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF1P09603 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF1P09603 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF1P09603 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF1P09603 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF1P09603 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF1P09603 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF1P09603 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF1P09603 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms