Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTIFO43310 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTIFO43310 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTIFO43310 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTIFO43310 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTIFO43310 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTIFO43310 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTIFO43310 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTIFO43310 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTIFO43310 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTIFO43310 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTIFO43310 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTIFO43310 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTIFO43310 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTIFO43310 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CTIFO43310 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTIFO43310 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTIFO43310 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTIFO43310 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTIFO43310 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTIFO43310 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CTIFO43310 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTIFO43310 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTIFO43310 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTIFO43310 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTIFO43310 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTIFO43310 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTIFO43310 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTIFO43310 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTIFO43310 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTIFO43310 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTIFO43310 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTIFO43310 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTIFO43310 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTIFO43310 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTIFO43310 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTIFO43310 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTIFO43310 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTIFO43310 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTIFO43310 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTIFO43310 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CTIFO43310 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTIFO43310 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTIFO43310 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTIFO43310 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTIFO43310 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTIFO43310 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTIFO43310 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTIFO43310 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTIFO43310 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTIFO43310 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CTIFO43310 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTIFO43310 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTIFO43310 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTIFO43310 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTIFO43310 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTIFO43310 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTIFO43310 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTIFO43310 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTIFO43310 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTIFO43310 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTIFO43310 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTIFO43310 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTIFO43310 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTIFO43310 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTIFO43310 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CTIFO43310 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTIFO43310 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTIFO43310 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTIFO43310 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTIFO43310 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTIFO43310 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTIFO43310 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTIFO43310 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTIFO43310 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTIFO43310 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTIFO43310 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTIFO43310 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTIFO43310 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTIFO43310 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTIFO43310 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTIFO43310 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTIFO43310 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTIFO43310 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTIFO43310 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTIFO43310 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTIFO43310 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CTIFO43310 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTIFO43310 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTIFO43310 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTIFO43310 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTIFO43310 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTIFO43310 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTIFO43310 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTIFO43310 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTIFO43310 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTIFO43310 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTIFO43310 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTIFO43310 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTIFO43310 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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