Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GNPATO15228 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GNPATO15228 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GNPATO15228 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GNPATO15228 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GNPATO15228 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GNPATO15228 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GNPATO15228 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GNPATO15228 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GNPATO15228 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GNPATO15228 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
GNPATO15228 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GNPATO15228 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GNPATO15228 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GNPATO15228 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GNPATO15228 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GNPATO15228 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GNPATO15228 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GNPATO15228 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GNPATO15228 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GNPATO15228 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GNPATO15228 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GNPATO15228 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GNPATO15228 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GNPATO15228 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GNPATO15228 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GNPATO15228 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GNPATO15228 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GNPATO15228 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GNPATO15228 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GNPATO15228 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GNPATO15228 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GNPATO15228 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GNPATO15228 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GNPATO15228 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GNPATO15228 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GNPATO15228 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GNPATO15228 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GNPATO15228 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GNPATO15228 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GNPATO15228 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GNPATO15228 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GNPATO15228 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GNPATO15228 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GNPATO15228 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GNPATO15228 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GNPATO15228 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GNPATO15228 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GNPATO15228 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GNPATO15228 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GNPATO15228 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GNPATO15228 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GNPATO15228 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GNPATO15228 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GNPATO15228 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GNPATO15228 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GNPATO15228 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GNPATO15228 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GNPATO15228 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GNPATO15228 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GNPATO15228 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GNPATO15228 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GNPATO15228 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GNPATO15228 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GNPATO15228 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GNPATO15228 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GNPATO15228 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GNPATO15228 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GNPATO15228 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GNPATO15228 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GNPATO15228 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GNPATO15228 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GNPATO15228 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GNPATO15228 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GNPATO15228 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GNPATO15228 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNPATO15228 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNPATO15228 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNPATO15228 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNPATO15228 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GNPATO15228 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNPATO15228 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNPATO15228 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNPATO15228 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNPATO15228 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNPATO15228 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNPATO15228 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNPATO15228 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNPATO15228 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNPATO15228 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNPATO15228 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GNPATO15228 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNPATO15228 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNPATO15228 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNPATO15228 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNPATO15228 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GNPATO15228 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GNPATO15228 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GNPATO15228 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GNPATO15228 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms