Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms