Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
E9PCH4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
E9PCH4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
E9PCH4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
E9PCH4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
E9PCH4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
E9PCH4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
E9PCH4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
E9PCH4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
E9PCH4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
E9PCH4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
E9PCH4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC27.54■■■□□ 2
E9PCH4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC27.54■■■□□ 2
E9PCH4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
E9PCH4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
E9PCH4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
E9PCH4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC27.54■■■□□ 2
E9PCH4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
E9PCH4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
E9PCH4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
E9PCH4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
E9PCH4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
E9PCH4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
E9PCH4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC27.53■■■□□ 2
E9PCH4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
E9PCH4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
E9PCH4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
E9PCH4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
E9PCH4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
E9PCH4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
E9PCH4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
E9PCH4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
E9PCH4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
E9PCH4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
E9PCH4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
E9PCH4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
E9PCH4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
E9PCH4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
E9PCH4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
E9PCH4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
E9PCH4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
E9PCH4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
E9PCH4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
E9PCH4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
E9PCH4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
E9PCH4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
E9PCH4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
E9PCH4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
E9PCH4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
E9PCH4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
E9PCH4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
E9PCH4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
E9PCH4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
E9PCH4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
E9PCH4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
E9PCH4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
E9PCH4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC27.51■■■□□ 2
E9PCH4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
E9PCH4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
E9PCH4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
E9PCH4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
E9PCH4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
E9PCH4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
E9PCH4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
E9PCH4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
E9PCH4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
E9PCH4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
E9PCH4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
E9PCH4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
E9PCH4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
E9PCH4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
E9PCH4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
E9PCH4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
E9PCH4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
E9PCH4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
E9PCH4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
E9PCH4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
E9PCH4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
E9PCH4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
E9PCH4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
E9PCH4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
E9PCH4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
E9PCH4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
E9PCH4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
E9PCH4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
E9PCH4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
E9PCH4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
E9PCH4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
E9PCH4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
E9PCH4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
E9PCH4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
E9PCH4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
E9PCH4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
E9PCH4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
E9PCH4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
E9PCH4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
E9PCH4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
E9PCH4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
E9PCH4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
E9PCH4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms