Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6V7

DDX49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX49Q9Y6V7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX49Q9Y6V7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms