Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHY1

NRBP1, Nuclear receptor-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRBP1Q9UHY1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRBP1Q9UHY1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRBP1Q9UHY1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRBP1Q9UHY1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRBP1Q9UHY1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRBP1Q9UHY1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NRBP1Q9UHY1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRBP1Q9UHY1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRBP1Q9UHY1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRBP1Q9UHY1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRBP1Q9UHY1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRBP1Q9UHY1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRBP1Q9UHY1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NRBP1Q9UHY1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
NRBP1Q9UHY1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRBP1Q9UHY1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms