Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHACTR1Q9C0D0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms