Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR8

KRTAP3-1, Keratin-associated protein 3-1, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-1Q9BYR8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP3-1Q9BYR8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms