Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms