Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERCC4Q92889 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms