Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF550Q7Z398 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms