Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM47EQ6ZV65 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms