Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms