Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VIRMAQ69YN4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms