Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TWISTNBQ3B726 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms