Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FXNQ16595 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FXNQ16595 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FXNQ16595 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FXNQ16595 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FXNQ16595 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FXNQ16595 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FXNQ16595 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FXNQ16595 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FXNQ16595 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FXNQ16595 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FXNQ16595 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FXNQ16595 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FXNQ16595 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FXNQ16595 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FXNQ16595 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FXNQ16595 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FXNQ16595 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FXNQ16595 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FXNQ16595 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FXNQ16595 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FXNQ16595 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FXNQ16595 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FXNQ16595 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FXNQ16595 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FXNQ16595 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FXNQ16595 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FXNQ16595 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FXNQ16595 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FXNQ16595 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FXNQ16595 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FXNQ16595 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FXNQ16595 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FXNQ16595 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FXNQ16595 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FXNQ16595 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FXNQ16595 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FXNQ16595 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FXNQ16595 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FXNQ16595 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FXNQ16595 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FXNQ16595 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FXNQ16595 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FXNQ16595 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FXNQ16595 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FXNQ16595 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FXNQ16595 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FXNQ16595 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FXNQ16595 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FXNQ16595 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FXNQ16595 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FXNQ16595 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FXNQ16595 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FXNQ16595 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FXNQ16595 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FXNQ16595 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FXNQ16595 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FXNQ16595 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FXNQ16595 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FXNQ16595 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FXNQ16595 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FXNQ16595 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FXNQ16595 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FXNQ16595 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FXNQ16595 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FXNQ16595 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FXNQ16595 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FXNQ16595 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FXNQ16595 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FXNQ16595 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FXNQ16595 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FXNQ16595 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FXNQ16595 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FXNQ16595 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FXNQ16595 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FXNQ16595 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FXNQ16595 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FXNQ16595 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FXNQ16595 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FXNQ16595 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FXNQ16595 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FXNQ16595 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FXNQ16595 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FXNQ16595 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FXNQ16595 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FXNQ16595 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FXNQ16595 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FXNQ16595 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FXNQ16595 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FXNQ16595 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FXNQ16595 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FXNQ16595 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FXNQ16595 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FXNQ16595 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FXNQ16595 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FXNQ16595 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FXNQ16595 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FXNQ16595 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FXNQ16595 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FXNQ16595 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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