Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC3Q14574 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms