Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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