Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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TRIM32Q13049 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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TRIM32Q13049 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM32Q13049 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TRIM32Q13049 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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TRIM32Q13049 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TRIM32Q13049 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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TRIM32Q13049 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
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TRIM32Q13049 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
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TRIM32Q13049 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
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TRIM32Q13049 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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TRIM32Q13049 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM32Q13049 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM32Q13049 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM32Q13049 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM32Q13049 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM32Q13049 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM32Q13049 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM32Q13049 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM32Q13049 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRIM32Q13049 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM32Q13049 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM32Q13049 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM32Q13049 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM32Q13049 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM32Q13049 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM32Q13049 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM32Q13049 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM32Q13049 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM32Q13049 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM32Q13049 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM32Q13049 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM32Q13049 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM32Q13049 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
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