Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 IL20RB-AS1-201ENST00000462176 562 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 AL109935.1-201ENST00000413249 473 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms