Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RIPK4P57078 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms