Protein–RNA interactions for Protein: P56851

EDDM3B, Epididymal secretory protein E3-beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDDM3BP56851 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDDM3BP56851 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EDDM3BP56851 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDDM3BP56851 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDDM3BP56851 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDDM3BP56851 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDDM3BP56851 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDDM3BP56851 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDDM3BP56851 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDDM3BP56851 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDDM3BP56851 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDDM3BP56851 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDDM3BP56851 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDDM3BP56851 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDDM3BP56851 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDDM3BP56851 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDDM3BP56851 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDDM3BP56851 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDDM3BP56851 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDDM3BP56851 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDDM3BP56851 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDDM3BP56851 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDDM3BP56851 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDDM3BP56851 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDDM3BP56851 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDDM3BP56851 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDDM3BP56851 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDDM3BP56851 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDDM3BP56851 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDDM3BP56851 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDDM3BP56851 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDDM3BP56851 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDDM3BP56851 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDDM3BP56851 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDDM3BP56851 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDDM3BP56851 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDDM3BP56851 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDDM3BP56851 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDDM3BP56851 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDDM3BP56851 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms