Protein–RNA interactions for Protein: P40222

TXLNA, Alpha-taxilin, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXLNAP40222 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TXLNAP40222 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TXLNAP40222 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TXLNAP40222 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TXLNAP40222 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TXLNAP40222 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TXLNAP40222 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TXLNAP40222 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TXLNAP40222 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TXLNAP40222 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TXLNAP40222 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TXLNAP40222 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TXLNAP40222 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TXLNAP40222 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TXLNAP40222 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TXLNAP40222 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TXLNAP40222 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TXLNAP40222 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TXLNAP40222 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TXLNAP40222 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TXLNAP40222 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TXLNAP40222 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TXLNAP40222 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TXLNAP40222 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TXLNAP40222 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TXLNAP40222 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TXLNAP40222 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TXLNAP40222 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TXLNAP40222 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TXLNAP40222 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TXLNAP40222 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TXLNAP40222 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TXLNAP40222 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TXLNAP40222 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TXLNAP40222 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TXLNAP40222 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TXLNAP40222 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TXLNAP40222 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TXLNAP40222 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TXLNAP40222 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TXLNAP40222 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TXLNAP40222 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TXLNAP40222 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TXLNAP40222 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TXLNAP40222 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXLNAP40222 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms