Protein–RNA interactions for Protein: P04259

KRT6B, Keratin, type II cytoskeletal 6B, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6BP04259 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT6BP04259 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT6BP04259 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT6BP04259 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT6BP04259 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT6BP04259 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT6BP04259 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT6BP04259 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT6BP04259 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT6BP04259 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT6BP04259 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT6BP04259 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms